Закладной камень в основание Владимирского скита был освящен Святейшим Патриархом Московским и всея Руси Алексием II в день памяти основателей Валаамского монастыря преподобных Сергия и Германа Валаамских 11 июля 2002 года.

21 сентября 2008 года, в праздник Рождества Пресвятой Богородицы Святейший Патриарх Московский и всея Руси Алексий II совершил чин Великого освящения храмового комплекса Владимирского скита в Спасо-Преображенской Валаамской обители и первую Божественную литургию в новоосвященном храме.

Перед началом богослужения Предстоятель Русской Православной Церкви обратил внимание присутствующих на то, что возведение храмового комплекса Владимирского скита свидетельствует о развитии Валаамского монастыря.